Dengan mengartikulasikan misi program studi dan hasil review dari internal dan eksternal terhadap rumusan tujuan pendidikan, maka tujuan dari program studi PAI Fakultas Tarbiyah UNIDA Gontor ditetapkan sebagai berikut:

  1. Terlaksananya proses pembelajaran yang menekankan aspek Metodologi Pembelajaran Agama Islam yang mampu merespon tantangan global;
  2. Berkembangnya tradisi penelitian dengan kualifikasi utama di bidang Metodologi Pembelajaran Agama Islam.
  3. Terlaksananya pengabdian kepada masyarakat di bidang Metodologi Pembelajaran Agama Islam.
  4. Terciptanya jaringan kerja baik di dalam maupun di luar negeri.